维普期刊查重入口检测论文参考文献的方法包括利用维普期刊提供的查重工具进行自查，也可以通过其他第三方查重软件进行检测。另外，可以借助文献查重专家进行人工查重，确保论文的原创性和学术性。

在进行维普期刊查重入口检测论文参考文献时，还可以采用文献比对的方法，将论文中的参考文献与维普期刊数据库进行比对，以确保引用的文献符合学术规范，并避免抄袭行为的发生。此外，还可以使用反抄袭软件对论文中的参考文献进行检测，以保证学术诚信。